Caros,
Amanhã trabalharemos na prática com uma grande matriz de dados moleculares. Ela pode ser BAIXADA AQUI.
O conjunto de dados é um alinhamento de 2487 posições de bases para 204 táxons terminais. São fragmentos conservados do gene PRDM12, relacionado à expressão de nociceptores (receptores de dor) em Homo sapiens e outros Metazoa. As sequências foram extraídas do GeneBank, alinhadas e cortadas nas posições menos conservadas.
Inicialmente, abra a matriz no WINCLADA, mude as cores dos estados de caráter (A, T, C, G) e faça uma análise heurística (com 100 réplicas). Não se esqueça de aumentar o espaço de árvore (Maximum trees to keep) para 10000. Salve os arquivos .tre e .emf do consenso estrito e do consenso de maioria e envie para o monitor.
Agora faça uma análise de bootstrap, com 100 réplicas, e salve o arquivo .emf do resultado. Faça o mesmo para o jacknife (com 100 réplicas). Envie ambos para o monitor.
Abraços,
Charles
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