Alinhamentos de sequências de bases

Caros,

Para fazer alinhamentos de forma relativamente simples, é possível utilizar o software Seaview (sugestão do Hector, colega de turma de vocês).

O programa pode ser baixado em http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview3.html (Clicar em MS Windows).

Baixe o software. Após descompactar os arquivos, abra o aplicativo (seaview.exe).

Vá em File --> Open Fasta

Abra o o arquivo pax6_seq.fst. Essas sequências são do Pax6, relacionado à expressão de estruturas fotorreceptoras (como olhos).

Clique em Props-->Alignment options-->clustalw

Clique em Edit-->Align all sequences

O resultado será o alinhamento de todas as sequências listadas. Essas sequências podem ser posteriormente transformadas em matrizes de dados e analisadas via parcimônia no Winclada.

Salve o alinhamento em Save as --> pax6alinhado.fst. Mande para o monitor.