Caros,
O protocolo da aula prática desta terça-feira (26/09) pode ser BAIXADO AQUI. Essas primeiras atividades serão feitas manualmente.
Abraços,
Charles
segunda-feira, 25 de setembro de 2017
segunda-feira, 18 de setembro de 2017
Texto para as duas primeiras aulas: "Os dinossauros de Hennig"
Caros,
Um artigo de minha autoria (em português) pode funcionar como uma introdução às aulas.
Ele foi publicado em 2008 na Scientiae Studia. Versa sobre a importância da definição de grupos naturais e como se desenvolveu a prática classificatória desde a Antiguidade até Hennig.
Baixe o artigo clicando na referência:
Boa leitura a todos!
Charles
Ementa da disciplina e referências bibliográficas_2017
Código: NH1602
TPI: 2-2-4
Carga Horária: 48 horas
Ementa: Histórico da biologia comparada; classificações evolutivas: Darwin, Wallace, Haeckel; taxonomia evolutiva; Hennig e a sistemática filogenética; sistemática molecular vs morfológica; histórico da biogeografia; dispersalismo; deriva continental; Croizat e a vicariância; biogeografia cladística e panbiogeografia.
Bibliografia Básica:
AMORIM, Dalton de Souza. Fundamentos de sistemática filogenética. Ribeirão Preto: Holos, 2002. 154 p.
BROWN, James H; LOMOLINO, Mark V. Biogeografia. 2 ed. Ribeirão Preto: FUNPEC, 2006. 691 p.
COX, C. Barry; MOORE, Peter D. Biogeografia: uma abordagem ecológica e evolucionária. 7 ed. Rio de Janeiro: LTC, 2009. 398 p.
Bibliografia Complementar:
CARVALHO, Claudio J. B. de (org); ALMEIDA, Eduardo A. B. Biogeografia da América do Sul: padrões e processos. São Paulo: Roca, 2010. 306 p.
CRISCI, Jorge Victor; KATINAS, Liliana; POSADAS, Paula. Historical biogeography: an introduction. Cambridge, MA:Harvard University Press, 2003. x, 250 p. Includes bibliographical references (p. 210-239).
FUTUYMA, Douglas J. Biologia evolutiva. 2 ed. Ribeirão Preto: FUNPEC-RP, 2002. 631 p.
LOMOLINO, Mark V; SAX, Dov F; BROWN, James H (Eds.). Foundations of biogeography: classic papers with commentaries. Chicago: University of Chicago Press, 2004. 1291 p.
MAYR, Ernst. The Growth of Biological Trought: diversity, evolution,and inheritance. Cambridge: The Belknap Press ofHarvard University, 1982. ix, 974 p. includes notes, references, glossary, and index (p. [859] - 974).
MORRONE, Juan J. Evolutionary biogeography: an integrative approach with case studies. New York: Columbia University Press, c2009. xvi, 301 p.
Cronograma das Aulas_2017
Aula 1 - 19/09
Apresentação do curso
Histórico da Sistemática. Taxonomia evolutiva, Fenética, Cladística
Anatomia de um cladograma
Tipos de caracteres (binários, multiestados, ordenados e não-ordenados)
Bases filosóficas da cladística (parcimônia)
Aula 2 - 26/09
Teoria
Tipos de codificação de caracteres: codificação composicional máxima, codificação dependente, codificação contingente e codificação redutiva máxima.
Grupos-externos. Enraizamento e polarização
Análise de congruência utilizando argumentação Hennigiana.
Prática
Análise manual de matrizes (argumentação Hennigiana)
Codificação, montagem de matrizes.
Análise de congruência
Aula 3 - 03/10
Teoria
Otimização de caracteres. Otimização de Wagner, de Fitch e de Dollo.
Prática
Codificação e argumentação Hennigiana
Aula 4 - 10/10
Teoria
Consenso, técnicas de consenso: consenso estrito, semi-estrito (de componentes combinados), consenso de maioria.
Medidas: comprimento da árvore, índice de consistência (por caráter e para a AMP), índice de retenção (por caráter e para a AMP).
Prática
Introdução aos softwares: Winclada e NONA
Codificação de caracteres, montagem de matrizes
Busca pelas topologias mais parcimoniosas. Visualização de árvores
Aula 5 - 17/10
Teórica:
Medidas de suporte: bootstrap, jacknife, suporte de Bremer.
Análise de sensibilidade como forma de se obter suporte de clados.
Prática:
Resolução de consensos à mão.
Cálculos de índices e medidas de suporte.
Consensos com o Winclada.
Aula 6 - 24/10
Aula 6 - 24/10
Teoria
Papel dos missing values.
Dados paleontólogicos. Dados morfológicos vs dados moleculares. Dados de ontogenia.
Pesagem não-diferencial e diferencial
Prática
Análises no Winclada.Aula 7 - 31/10
Avaliação: Prova 1 Teórico/Prática
Aula 8 - 07/11
Teoria
Introdução à Biogeografia
História
Principais autores
Tectônica de placas – história e desenvolvimentos
Aula 9 - 14/11
Teoria
Escolas de sistemática modernas
Métodos biogeográficos (Panbiogeografia, Biogeografia Cladística, PAE, etc.)
Prática
Delimitação de áreas de endemismo
Aplicação de métodos biogeográficos
Aula 10 - 21/11
Teoria
Biogeografia cladística
Prática
Aplicação de métodos em biogeografia cladística
Aula 11 - 28/11
Teoria
Biogeografia cladística
Prática
Aplicação de métodos em biogeografia cladística
Aula 12 - 05/12
Avaliação: Prova 2 Teórico/Prática
Exame: se necessário, no dia 12/12.
Assinar:
Postagens (Atom)